为确保北京人民喝上放心水，淅川县委、县政府明确提出 “把政绩融在清水里，把丰碑铸在青山上”，集全县之力，采取各种措施，开展水质保护工作。一是全面开展水污染防治。在工业污染治理上，按照调水对工业环保的要求，制定了《淅川县南水北调中线工程水源地水质保护实施意见》，关停了52家污染较重的企业，其中排污大户泰龙纸业集团制浆生产线关闭后，工业废水排放量每年减少300万吨；以结构调整为主线，因企制宜，分类施策，先后建成治污设施160台（套），福森药业公司、丰源氯碱厂、汽车配件厂、铝业集团、淅水集团等重点工业企业实现了环保设施上档升级。在面源污染治理上，大力发展无公害农业，强力推进沼气建设，控制化肥农药的使用量，推广使用生物肥、复合肥，强化牲畜圈养和粪便无害化处理。目前，已在沿丹江库区的8个乡镇、21个村修建沼气池3万余个。二是强力推进生态建设。以退耕还林、项目造林为依托，按照“深山封山育林，浅山退耕还林，丘陵发展林果，滩涂造速生林”的指导思想，坚持不懈地搞好生态建设。完成人工造林46.6万亩，飞播造林6万亩，封山育林40万亩，退耕还林11.4万亩，通道绿化190公里，全县的森林覆盖率由“九五”末的15%提高到目前的38%。三是扎实搞好水土保持。重点以农田水利基本建设为载体，以小流域治理为单元，坚持工程措施与生物措施、治坡与治沟、蓄水与排水相结合，围绕保水、保土，全面进行小流域治理。目前已累计投入6700万元，对19条流域进行了综合整治，治理面积750平方公里，治理区植被覆盖率由15%提高到58%，平均土壤浸蚀模数由4100吨/平方公里减少到1000吨/平方公里以下，年减少土壤流失210多万吨。四是集中搞好专项整治行动。主要采取“广覆盖、抓重点”的方式，部门联动，合力整治，先后开展了取缔非法冶钒、非法皂素加工、非法选铁、水污染防治等环保专项整治行动。目前，全县已关闭和取缔小金属镁、地条钢、蚕丝印染、小化工、小皂素企业17家，关闭大理石企业8家，淘汰容量在3200千伏安以下的小冶炼炉32台，取缔非法冶钒企业124家，非法选铁11家，清查处理放射源3家。五是严禁新上污染项目。多年来，对新上工业项目实施严格的环保准入制度。凡是新建项目，无论项目再大，效益再高，都必须严格执行环保审批程序，严格进行环境影响评价。几年来先后否定6个大型建设项目的选址方案，终止10个大中型建设项目的前期工作，取缔20个违规项目的建设，有力地促进了水源地的水质保护工作。
    目前，丹江水库水质除总氮超标外，总磷、氨氮、氢化物等25项指标均达到或优于二类水质标准，符合调水要求。